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空间背景对推断更深层次的生物学意义的重要性是毋庸置疑的,但技术掣肘在历史上限制了各种应用的广泛采用,例 如敏感性、劳动力广泛性、组织类型依赖性以及获取详细单细胞信息的能力有限等。下表从样本类型、空间类型、有效 率、优缺点的角度将各种技术进行了对比,以供大家按需选择。
虽然先前大部分的技术正在被迅速弃用,但它们背后的思想和方法是当代空间转录组学的基础。为了追求更为广泛采 用的技术,已经从学术界衍生出一些商业努力。10X Genomics收购了Spatial (更名为Visium )、ReadCoor和 . Cartana。ReadCoor的核心技术是荧光原位测序技术FISSEQ。Cartana的核心技术为锁式探针( Padlock) , 进行滚 环扩增后测序,达到了亚细胞水平。NanoString在2019年推出自动化仪器GeoMx ,捕获基因数量已超过22000 ,之后又 发布GeoMx Digital Spatial Profiler ,达到了单细胞的分辨率。另外,华大基因( BGI )在2013年收购了专注于人类全 基|因组精准测序的Complete Genomics , 将细胞或组织嵌入芯片,产生高分辨率的空间解析数据。尽管如此,目前空间 转录组方案仍然是定制的,只能在少数实验室中使用,且费用高昂。因此,探寻一种更为广泛采用的新技术是非常迫切且 有必要的。#flag标签快速免疫沉淀套装#磷酸化抗体定制#斑马鱼抗体定制
来自宾夕法尼亚大学、Jackson基因组医学实验室、康涅狄格大学健康中心等处的研究人员 ,揭示-种叫做Morrbid的新型长链非编码 RNA ( IncRNA )调控了Bim及短寿骨髓细胞的寿命。这一重要的研究发现发布在8月15日的 《自然》( Nature )杂志上。 纽约大学医学院的Richard A. Flavell ,夕法尼亚大学的Jorge Henao-Mejia ,以及Jackson基因组医学实验室的Adam Williams是这篇 论文的共同通讯作者。Flavell教授是美国科学院院 士,世界闻名的免疫学家。现任美国耶鲁大学医学院免疫学系终身教授、系主任,霍华德休 斯医学研究所主任兼任分子细胞生物学、发育生物学系教授。 中性粒细胞、嗜酸性粒细胞和“经典型”单核细胞共同占据了人类血液白细胞总数的约70% ,是机体内最短寿的细胞。精确调控这些骨髓 细胞的寿命对于维持保护性的免疫反应,同时将较长时间炎症造成的有害后果减到最小起至关重要的作用。然而,当前对于严格控制这些细胞 寿命的机制却不是很清楚。 IncRNA是一类长度超过200个核苷酸、 不编码蛋白质的功能性RNA分子。IncRNA通过表观遗传修饰与转录调控、转录后加工、翻译调控 等多种机制,在细胞生命活动中发挥重要作用。近年来的研究揭示, IncRNA在免疫系统中起着非常重要的作用,而成为了免疫学关注的焦点。 它的表达异常可以影响多种免疫系统疾病的发生、发展及预后。#flag标签快速免疫沉淀套装#磷酸化抗体定制#斑马鱼抗体定制